Использование сапонитовых глин также возможно в медицинских целях. За рубежом природные минералы уже достаточно давно широко применяют в медицине в качестве лечебных средств. Примерами таких лекарственных средств, например, являются Смекта (Бофур Ипсен, Франция), Каопектат (Фармацея Апджон, США), Литовит (АОЗТ НПФ Новь, Россия).

Благодаря проведенным исследованиям, обнаружены и практически подтверждены свойства эффективного действия сорбционных материалов, изготовленных из природного активированного сапонита, используемых в качестве энтеросорбентов для деинтоксикации организма и освобождения его от патогенных бактерий и вирусов; выявлены высокие сорбционные свойства активированного сапонита при выводе из организма солей тяжелых металлов и радионуклидов; доказана возможность изготовления пищевых добавок и лечебных препаратов; изучены высокие фильтрационные возможности при очищении воды от патогенных вирусов в водной среде; изучена сорбционная активность сапонита и получены хорошие результаты по блокированию жизнедеятельности энтеровирусов, гепатита А и полиомиелита, а также патогенных микроорганизмов — кишечной палочки, сальмонеллы, золотистого стафилококка.

Положительный эффект дает использование сапонита в качестве антацидного препарата при монотерапии больных язвой двенадцатиперстной кишки.